Les médailles sont conservées dans leurs boîtes d'origine (en carton, en plastique ou en bois). Il a été décidé de garder ces conditionnements, qui bien que par forcément réglementaires aux normes de conservations des documents d'archives, assurent une protection aux médailles contre les chocs, la lumière, la poussière.

Chaque médaille a été cotée et décrite, puis organisée intellectuellement au sein d'un plan de classement thématique.

Archives municipales et communautaires de Besançon

On peut également consulter les deux versements du service Relations internationales, composés de cadeaux faits au Maire de Besançon par les représentants des villes jumelées (versements 11Fi et 970W).