Documents relatifs aux congrégations religieuses établies dans la ville de Besançon - Etat des biens fonds possédés par les ecclésiastiques et maisons religieuses dans la Cité (1694) - Lettres écrites à la municipalité touchant la réforme du couvent des Cordeliers (1501-1647) - Documents concernant la réforme du monastère des grands Carmes (XVI° siècle) - Traité de réception des Carmes déchaussés dans la Cité et documents relatifs aux difficultés des religieux avec la ville (1639-1721) - Documents relatifs à la réforme de Couvent des Dominicains (1640-1652) - Lettres patentes de l'Empereur Maximilien chargeant la municipalité de Besançon de veiller sur le temporel du prieur de Jussan-Moutier (1503-1508) - Lettre de l'Empereur Ferdinand III au sujet de l'installation des Minimes dans le Prieuré de Jussan-Moutier (4 mars 1640) - Etablissement des Oratoriens à Besançon et copie du traité pour le Collège Granvelle (1630-1647) - Lettre du Commandeur du Temple de Salins au sujet de biens délaissés à Besançon (1647) - Documents relatifs aux Bénédictins de Saint Vincent (1487-1777) - Inventaire du mobilier d'une maison possédée à Besançon par l'Abbaye de Bellevaux (17 mars 1550) - Actes de fondation et dotation d'un couvent de Carmélites à Besançon par la famille Bereur de Dole (1616-1617) - Lettre de l'Empereur Ferdinand II pour l'établissement à Besançon d'un couvent de Visitandines (23 février 1629) - Document concernant les Ursulines (1641) - Documents relatifs aux Annonciades de Pontarlier (1639), à l'établissement à Besançon des Annonciades de Dole ; Lettre d'Antoine Brun en leur faveur (1644-1648) - Etablissement à Besançon des Bénédictines (1654-1706)